1、超声波破碎均质仪
该类型的均质器主要用于各种组织捣碎/细胞裂解、细胞器、核酸、蛋白的提取，以及其他工业样品的乳化、均质。其优点是：使用方便，通过更换不同的探头，可以处理不同量的样品;乳化、均质效果好，适合单样品操作。缺点：不能同时处理多个样品，不同样品需要更换或清洗探头，增加样品间交叉污染的机会;对有特殊要求的生物样品具有一定的影响性。
2、探头旋刃式均质仪
该类型是通过研磨杵在均质器内转动，达到分离、混匀、破碎、均质的目的，适合处理韧性强的样品。用于分散动物/植物组织，配合裂解液做核酸、蛋白等的抽提，也可用于工业上树脂、色素制造悬浮/乳浊液等。该类型的均质器的主要优点：具有低速、扭力大、无噪音等特点。使用方便，通过更换不同的探头，可以处理不同量的样品，操作简便，更适合单样品操作。缺点：不能同时处理多个样品，不同样品需要更换或清洗探头，增加样品间交叉污染的机会;对于细菌、酵母及其他真菌等厚壁样品的处理不考虑该类均质器。
3、敲打式均质仪
敲打式均质仪通过敲击样本，产生的压力可将样本击碎混匀。
4、研磨式均质仪
研磨珠均质仪是将样品和相应的珠子放到试管里通过三维高速旋转、振动，靠研磨珠的高速敲打方式对样品进行研磨、均质将样品打碎，适用范围广。用于动物和植物组织、藻类、细菌、酵母、真菌或霉菌以及各类孢子体的破碎，DNA/RNA、蛋白的提取。其优点是能够高效地处理包括骨头、孢子、土壤等在内的顽固样品，均质仪的每一个均质管子都有各自的研磨珠可以避免交叉污染，操作简便、高效。
